작성자: 14기 김혜림 [참고자료] https://www.youtube.com/watch?v=1YHsSFWn5OA&t=4319s https://www.youtube.com/watch?v=MHb18hhKQsY [이미지 출처] 더보기 Figure 1 : https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%8B%A8%EB%B0%B1%EC%A7%88_%EC%A0%91%ED%9E%98 Figure 2, 3 : https://www.youtube.com/watch?v=MHb18hhKQsY&t=86s Figure 4 : https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_sequence_alignment Figure 5,6,7,8 : https://www.youtube.com/watch?v..

심화 스터디/의료 데이터 스터디 2021. 11. 26. 14:00

작성자 : 채윤병 참고 : MIT spring 2021 6.874 Computational system biology lecture 15 일반적인 ML, deep learning의 경우 데이터의 형태가 이미지, 텍스트, 수치와 같은 형태 생물 데이터(gene-gene, cell-cell, protein-protein)의 경우 데이터간의 연관성이 매우 복잡하게 얽혀있기 때문에 일반적인 데이터 형태로 표현하기가 어려움 >> Graph network 형태로 데이터를 표현 데이터의 형태에서 Node는 drug discovery의 경우 약물이 될 수도 있고 gene, protein등이 될 수 있다. Edge의 경우 Node들 간의 연관성을 담고 있다. (그렇지만 Drug discovery와 같은 분야에서 일반적인..

심화 스터디/의료 데이터 스터디 2021. 11. 11. 20:33

작성자: 14기 김혜림 [참고논문] https://arxiv.org/pdf/1707.02921.pdf [들어가기 전] Super Resolution 이란? 화질을 개선하는 task 라고 생각하면 될 것 같다. 얼마전에 LG에서는 이미지 화질 개선 대회를 개최했을만큼(지금은 끝났지만), 실생활과도 맞닿아 있는 주제이다. 실은 컴퓨터 비전의 어떤 분야가 안 그렇겠냐만은. Super Resolution은 Classificaiton이나 Object detection과 같은 high level의 컴퓨터 비전 분야는 아니고 low level 컴퓨터 비전이라고 한다. 한편 최근 딥러닝 기법들이 발전해옴에 따라 SR 분야도 이를 적용해서 좋은 성능을 내는 연구들이 나오고 있는데, 이전까지는 CNN 을 이용했다면 최근은..

심화 스터디/의료 데이터 스터디 2021. 9. 30. 20:45

작성자: 14기 김혜림 [참고 논문] https://arxiv.org/pdf/2006.01409.pdf https://arxiv.org/pdf/2005.08235.pdf COVIDGR Dataset and COVID-SDNet Methodology for Predicting COVD-19 Based on Chest X-Ray Images 초록 Abstract COVID-19를 검사하는 방법은 크게 RT-PCR, CT, Chest X-Ray(이하 CXR) 로 나눌 수 있다. 세 가지 방법중 CXR는 time/cost 효율적이며 대부분의 병원에서 이용가능하다는 장점이 있다. 따라서 CXR 이미지를 DNN 구조를 거쳐 classification 하고자 한 것이 본 논문의 목표이다. 그러나 현존하는 데이터셋은 ..

심화 스터디/의료 데이터 스터디 2021. 9. 16. 21:11

팀원 14기 김소형, 14기 김혜림, 14기 박상준, 14기 이연정, 14기 채윤병, 14기 허준영 주제 크게 두 가지 주제에 대해 스터디하고자 함 주제 진행방식 의료 이미지 분석 영상 시청 [참조] (리뷰 1人) + 해당 주차의 소주제 관련 논문 선정 후 리뷰 (2人) 생체정보학(유전체) 미정 - 헬스케어(추후 일정을 보고 논의) 커리큘럼 주차(날짜) 소주제 발표자 0주차(0907) OT 1주차(0916) medical image classificatoin(영상 1, 2~4) 연정(영상리뷰) 윤병 혜림 (논문리뷰) 2주차(0923) medical image segmentation(영상 6~8) 소형(영상리뷰) 재찬(논문리뷰) 3주차(0930) medical image enhancement(영상 9~11..

심화 스터디/의료 데이터 스터디 2021. 8. 27. 17:48